Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad23aP54726 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms