Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PctpP53808 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PctpP53808 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PctpP53808 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PctpP53808 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PctpP53808 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PctpP53808 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PctpP53808 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PctpP53808 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PctpP53808 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PctpP53808 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PctpP53808 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PctpP53808 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PctpP53808 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PctpP53808 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PctpP53808 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PctpP53808 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PctpP53808 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PctpP53808 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PctpP53808 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PctpP53808 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PctpP53808 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PctpP53808 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PctpP53808 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PctpP53808 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PctpP53808 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PctpP53808 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PctpP53808 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PctpP53808 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PctpP53808 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PctpP53808 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PctpP53808 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PctpP53808 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PctpP53808 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PctpP53808 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PctpP53808 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PctpP53808 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PctpP53808 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PctpP53808 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PctpP53808 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PctpP53808 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PctpP53808 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PctpP53808 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PctpP53808 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PctpP53808 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PctpP53808 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PctpP53808 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PctpP53808 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PctpP53808 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PctpP53808 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PctpP53808 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PctpP53808 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PctpP53808 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms