Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fdft1P53798 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fdft1P53798 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms