Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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