Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux1P53564 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux1P53564 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux1P53564 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux1P53564 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux1P53564 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux1P53564 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux1P53564 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms