Protein–RNA interactions for Protein: P52850

Ndst2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst2P52850 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst2P52850 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndst2P52850 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms