Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox5P52651 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox5P52651 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms