Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp1P52624 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp1P52624 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp1P52624 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp1P52624 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Upp1P52624 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp1P52624 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms