Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e3P52483 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms