Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1cP52432 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1cP52432 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms