Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfP51642 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfP51642 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfP51642 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfP51642 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfP51642 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfP51642 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfP51642 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfP51642 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfP51642 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfP51642 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfP51642 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfP51642 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfP51642 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CntfP51642 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CntfP51642 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfP51642 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfP51642 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfP51642 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfP51642 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfP51642 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfP51642 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfP51642 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfP51642 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfP51642 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfP51642 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfP51642 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfP51642 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfP51642 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfP51642 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfP51642 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfP51642 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfP51642 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CntfP51642 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CntfP51642 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CntfP51642 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CntfP51642 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CntfP51642 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms