Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RorcP51450 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RorcP51450 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RorcP51450 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RorcP51450 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms