Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RoraP51448 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RoraP51448 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RoraP51448 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RoraP51448 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RoraP51448 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RoraP51448 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RoraP51448 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RoraP51448 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RoraP51448 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RoraP51448 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RoraP51448 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RoraP51448 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RoraP51448 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RoraP51448 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RoraP51448 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RoraP51448 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RoraP51448 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RoraP51448 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RoraP51448 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RoraP51448 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RoraP51448 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RoraP51448 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RoraP51448 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RoraP51448 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RoraP51448 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RoraP51448 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RoraP51448 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RoraP51448 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RoraP51448 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RoraP51448 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RoraP51448 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RoraP51448 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RoraP51448 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RoraP51448 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RoraP51448 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RoraP51448 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RoraP51448 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RoraP51448 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RoraP51448 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RoraP51448 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RoraP51448 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RoraP51448 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RoraP51448 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RoraP51448 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RoraP51448 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RoraP51448 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms