Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FmodP50608 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FmodP50608 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FmodP50608 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FmodP50608 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FmodP50608 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FmodP50608 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FmodP50608 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FmodP50608 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FmodP50608 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FmodP50608 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FmodP50608 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms