Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc13P50207 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms