Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psen1P49769 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psen1P49769 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psen1P49769 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psen1P49769 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psen1P49769 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psen1P49769 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psen1P49769 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms