Protein–RNA interactions for Protein: P49718

Mcm5, DNA replication licensing factor MCM5, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcm5P49718 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mcm5P49718 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mcm5P49718 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mcm5P49718 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mcm5P49718 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mcm5P49718 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mcm5P49718 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mcm5P49718 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms