Protein–RNA interactions for Protein: P49660

Sstr4, Somatostatin receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr4P49660 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr4P49660 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms