Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp3P49194 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms