Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnni3P48787 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms