Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrprbP47758 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrprbP47758 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrprbP47758 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SrprbP47758 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrprbP47758 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms