Protein–RNA interactions for Protein: P46467

Vps4b, Vacuolar protein sorting-associated protein 4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4bP46467 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps4bP46467 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4bP46467 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms