Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkn1bP46414 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms