Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syt1P46096 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syt1P46096 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syt1P46096 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt1P46096 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt1P46096 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt1P46096 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt1P46096 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt1P46096 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syt1P46096 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms