Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf4P43488 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms