Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ItgavP43406 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgavP43406 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgavP43406 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgavP43406 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgavP43406 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgavP43406 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgavP43406 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgavP43406 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgavP43406 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgavP43406 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgavP43406 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms