Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx1P43345 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms