Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PtgfrP43117 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms