Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms