Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VhlP40338 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VhlP40338 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VhlP40338 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VhlP40338 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VhlP40338 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VhlP40338 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VhlP40338 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VhlP40338 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VhlP40338 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VhlP40338 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VhlP40338 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
VhlP40338 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VhlP40338 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
VhlP40338 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VhlP40338 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VhlP40338 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VhlP40338 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VhlP40338 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VhlP40338 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VhlP40338 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VhlP40338 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VhlP40338 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VhlP40338 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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