Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms