Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd9P40240 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd9P40240 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd9P40240 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd9P40240 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd9P40240 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms