Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd1P40201 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd1P40201 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd1P40201 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd1P40201 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd1P40201 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chd1P40201 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chd1P40201 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chd1P40201 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Chd1P40201 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Chd1P40201 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd1P40201 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd1P40201 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd1P40201 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd1P40201 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd1P40201 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd1P40201 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd1P40201 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms