Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fen1P39749 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fen1P39749 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fen1P39749 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fen1P39749 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms