Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik2P39087 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms