Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ercc5P35689 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms