Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpardP35396 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PpardP35396 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpardP35396 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpardP35396 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpardP35396 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpardP35396 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpardP35396 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpardP35396 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpardP35396 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpardP35396 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpardP35396 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpardP35396 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpardP35396 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpardP35396 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpardP35396 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpardP35396 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpardP35396 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpardP35396 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpardP35396 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpardP35396 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpardP35396 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpardP35396 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpardP35396 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpardP35396 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpardP35396 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpardP35396 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpardP35396 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpardP35396 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpardP35396 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PpardP35396 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PpardP35396 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PpardP35396 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PpardP35396 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PpardP35396 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PpardP35396 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PpardP35396 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PpardP35396 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PpardP35396 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PpardP35396 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpardP35396 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpardP35396 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpardP35396 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PpardP35396 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpardP35396 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PpardP35396 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PpardP35396 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpardP35396 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpardP35396 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpardP35396 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpardP35396 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpardP35396 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpardP35396 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpardP35396 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpardP35396 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpardP35396 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpardP35396 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpardP35396 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpardP35396 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpardP35396 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpardP35396 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpardP35396 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpardP35396 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpardP35396 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpardP35396 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpardP35396 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpardP35396 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpardP35396 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpardP35396 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PpardP35396 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms