Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sftpa1P35242 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sftpa1P35242 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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