Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp4P35123 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp4P35123 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp4P35123 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp4P35123 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp4P35123 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp4P35123 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp4P35123 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp4P35123 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp4P35123 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp4P35123 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp4P35123 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp4P35123 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp4P35123 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp4P35123 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp4P35123 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp4P35123 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp4P35123 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp4P35123 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp4P35123 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp4P35123 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp4P35123 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp4P35123 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp4P35123 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms