Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pola1P33609 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pola1P33609 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pola1P33609 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pola1P33609 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pola1P33609 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pola1P33609 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pola1P33609 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pola1P33609 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pola1P33609 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms