Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp13P33435 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp13P33435 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp13P33435 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp13P33435 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp13P33435 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp13P33435 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms