Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd1P33215 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms