Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc1P29341 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms