Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpbP27790 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpbP27790 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpbP27790 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpbP27790 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpbP27790 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpbP27790 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpbP27790 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms