Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3P27659 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms