Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 4931417E11Rik-201ENSMUST00000070163 1095 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 1700013D24Rik-201ENSMUST00000112537 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Hoxd11P23813 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Hoxd11P23813 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Hoxd11P23813 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Hoxd11P23813 Olfr1178-201ENSMUST00000075640 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd11P23813 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Hoxd11P23813 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm18881-201ENSMUST00000220450 1545 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms