Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms