Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms