Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja1P23242 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja1P23242 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms