Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PparaP23204 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PparaP23204 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PparaP23204 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PparaP23204 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PparaP23204 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PparaP23204 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PparaP23204 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PparaP23204 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PparaP23204 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PparaP23204 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PparaP23204 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PparaP23204 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PparaP23204 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PparaP23204 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PparaP23204 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PparaP23204 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PparaP23204 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PparaP23204 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PparaP23204 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PparaP23204 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PparaP23204 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PparaP23204 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PparaP23204 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PparaP23204 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PparaP23204 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PparaP23204 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PparaP23204 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PparaP23204 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PparaP23204 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PparaP23204 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PparaP23204 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PparaP23204 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PparaP23204 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PparaP23204 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PparaP23204 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PparaP23204 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PparaP23204 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PparaP23204 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PparaP23204 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PparaP23204 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PparaP23204 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PparaP23204 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PparaP23204 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PparaP23204 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PparaP23204 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PparaP23204 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PparaP23204 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PparaP23204 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PparaP23204 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PparaP23204 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PparaP23204 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PparaP23204 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PparaP23204 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PparaP23204 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PparaP23204 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PparaP23204 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PparaP23204 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PparaP23204 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PparaP23204 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PparaP23204 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PparaP23204 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PparaP23204 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PparaP23204 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PparaP23204 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PparaP23204 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PparaP23204 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PparaP23204 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PparaP23204 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PparaP23204 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PparaP23204 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PparaP23204 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PparaP23204 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PparaP23204 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PparaP23204 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PparaP23204 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PparaP23204 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms